СМИ

В экосистеме озера Байкал обнаружен ранее неизвестный «пласт» вирусного разнообразия. Российские исследователи выявили в байкальском планктоне 47 новых ДНК-вирусов, которые не имеют полных совпадений с уже описанными геномами из международных научных баз, сообщает «Наука в Сибири». © Shutterstock/FOTODOMРаботу провели специалисты Лимнологического института СО РАН и НИИ эпидемиологии и микробиологии имени Пастера. Для анализа они применили метагеномный подход — метод, позволяющий изучать генетический материал всех организмов в пробе воды без их лабораторного выращивания. Это особенно важно для вирусов, культивирование которых часто невозможно или требует слишком сложных условий. Учёные отбирали воду из Байкала, пропускали её через фильтры с порами 200 нанометров, отделяя вирусные частицы от бактерий, после чего проводили высокопроизводительное секвенирование ДНК. В результате внимание исследователей привлекла группа CRESS-вирусов — микроорганизмов с небольшим кольцевым геномом из одноцепочечной ДНК. Ранее они составляли менее одного процента от всех вирусных последовательностей в байкальских данных, из-за чего оставались практически незаметными. Генетический анализ показал, что все 47 обнаруженных вирусов являются уникальными. Хотя отдельные фрагменты их ДНК отдалённо схожи с вирусами, найденными в США, Швеции и Новой Зеландии, полного совпадения не выявлено. Самый близкий известный аналог был обнаружен в высокогорном озере Сара в Новой Зеландии и связан с пресноводной мидией, однако степень сходства ограничивается 77,2 процента на уровне аминокислот. По мнению авторов исследования, хозяевами байкальских CRESS-вирусов, вероятнее всего, являются местные беспозвоночные или рыбы. При этом проведённый сравнительный анализ не выявил признаков, указывающих на потенциальную опасность этих вирусов для человека. Результаты работы опубликованы в Journal of Great Lakes Research. В дальнейшем ученые планируют расширить географию отбора проб, чтобы глубже изучить вирусное разнообразие Байкала. Подписаться